根据《中共安徽省委办公厅 安徽省人民政府办公厅关于印发〈亳州市人民政府机构改革方案〉的通知》（厅〔2009〕37号），设立市科学技术局，为市政府工作部门。

（一）贯彻执行国家科学技术工作方针政策和法律法规；研究科技发展和科技促进全市经济与社会发展的重大问题，提出相关政策建议；研究确定全市科技发展的重大布局和优先领域；推动全市科技创新体系建设。

（二）负责编制全市科学技术发展的中长期规划和年度计划；负责组织申报与实施火炬计划、星火计划、成果推广计划等科技开发计划，科技攻关计划和软科学等研究发展计划。

（三）组织拟定高新技术产业化政策；初审并会同有关部门申报高新技术企业、产品、成果和高新技术产业化项目。

（四）组织拟订科技促进农村和社会发展的政策和措施，促进以改善民生为重点的农村建设和社会建设。

（五）组织拟订促进产学研结合的政策和措施，指导科技成果转化工作；组织相关科技成果应用示范，推动企业自主创新能力建设。

（六）负责归口管理的科技经费预决算及经费使用的监督管理，会同有关部门拟订科技资源合理配置的政策和措施。

（七）归口管理全市科技成果、科技奖励、科技保密、技术市场、民营科技和与科技相关的知识产权保护工作；拟订科普工作规划和政策，推动科普工作；负责相关科技统计工作；指导科技中介服务，推动科技服务体系建设。

（八）归口管理科技外事工作，协同有关部门组织技术出口和技术引进、消化、吸收、创新工作。

（九）指导协调全市各地、各部门的科技管理工作。

（十）承办市委、市政府交办的其他事项。